2004年5月27-28日，中国科学院基础科学局组织专家组对国家同步辐射实验室二期工程进行了工艺鉴定。工艺鉴定组由魏宝文院士任组长，陈森玉院士、陆坤权研究员任副组长，测试组成员由北京高能物理研究所、上海应用物理研究所、兰州近代物理研究所、中国工程院物理研究所及浙江大学等单位的11位专家组成。

专家们听取了工程经理兼总工程师刘祖平做的国家同步辐射实验室二期工程建设报告和分管加速器改造、光束线建设、实验站建设的副总工程师、总工艺师分别所做的三个报告；听取了专家测试组组长陈森玉院士代表测试组宣读的工艺测试报告；查阅了二期工程指挥部提供的专家测试组测试报告；并现场观察了机器运行情况。

鉴定组对测试报告给予了充分肯定，认为：通用光源模式的总体工艺指标和所有加速器、光束线子项的工程技术指标均达到或优于设计指标，改造后的合肥同步辐射装置的技术水平可以提高到新的高度，运行流强300mA，束流平均寿命大于8小时；超导扭摆磁铁(Wiggler)运行时，全部14条光束线可同时引出同步辐射光；所有新建实验站皆已基本具备向用户开放的条件，可以提供同步辐射用户使用；建议尽快组织验收，投入运行。

国家同步辐射实验室二期工程是经国家发改委批准的中科院“九五”期间的国家重大科学工程，在国家发改委、中国科学院的领导与支持下，经过国家同步辐射实验室全体科技人员的艰苦努力和拼搏，目前已基本建成。大大改善了合肥同步辐射装置，将为创新研究成果提供一个光束线和实验站更加完善的研究平台。