2004年12月14日，合肥国家同步辐射实验室二期工程正式通过由国家发展和改革委员会委托中国科学院主持的国家验收，这是中科院第一个通过国家验收的“九五”大科学工程。

白春礼副院长任国家验收委员会主任，秘书长李志刚、高能所方守贤院士、华中科技大学校长樊明武院士和国家发改委孟宪棠处长任副主任。委员来自国家发改委、科技部、基金委、国家档案局、中科院、安徽省、高校、科研单位的领导和专家共25人，其中“两院”院士还有朱清时、魏宝文、何多慧、邱爱慈、陈森玉。

国家验收委员会听取了工程建设报告、专家测试报告、工艺鉴定报告和预验收意见，查验了工程现场，查阅了文件、档案资料。国家验收委员会认为：国家同步辐射实验室通过二期工程建设，提高了装置技术水平，扩大了实验应用领域，基本完成了国家发展和改革委员会（原国家计委）批准的建设目标，同意二期工程通过国家验收。

从立项到竣工，工程建设者经过近八年的艰苦努力、团结奋斗、卓有成效的工作，终于取得了今天丰硕的成果。