2005年8月4-7日，合肥国家同步辐射实验室二期工程通过国家竣工验收后的首次用户会议在安徽天柱山召开。来自国内外高等院校、科研机构和企业共计45家单位的136位代表参加了此次会议。中科院基础局黄勇副局长、综合计划局郑晓年处长、基础局乔润龙处长及中科大副校长王东进出席了会议。黄勇副局长致开幕词，他指出合肥同步辐射光源目前的主要任务是稳定运行、提供用户服务，充分发挥光源的平台作用。他强调了用户专家委员会的作用，鼓励多学科课题交叉。王东进副校长代表学校表示将大力支持实验室的建设和开放，争取将校内同步辐射用户基金经费纳入学校预算。 

国家同步辐射实验室执行主任盛六四、实验室副主任李为民、实验部部长田杨超分别做了二期工程竣工验收后的整体工作、运行和开放情况的报告。美国斯坦福大学沈志勋教授、日本广岛大学乔山教授、加拿大同步辐射装置T.K.sham教授，以及大连化物所包信和所长、生物物理所所长饶子和院士、物理研究所周兴江研究员、高能所胡天斗研究员、上海应物所何建华研究员应邀做了精彩的报告，介绍了各自的科研成果及相关领域研究的最新进展。大会还听取了特邀代表及用户代表所做相关报告24个。

会议期间，选出了新的一届用户专家委员会，成员由来自13个科研单位的29人组成。主任杨学明（大连化物所）、副主任吴自玉（高能所）、周兴江（物理所）、封东来（复旦大学），秘书长由国家同步辐射实验室高琛担任。新的一届用户专家委员会就如何进一步发挥用户专家委员会的作用进行了讨论、评议了国家同步辐射实验室的开放运行工作、对实验室的发展提出了建议和希望。会议期间各实验站工作人员与用户进行了交流、讨论，听取了各线、站用户对用光机时申请、课题发展方向和实验技术方法等方面的意见和建议。