2006年6月22-23日，上海应用物理所召开了上海光源（SSRF）应用研究研讨会。来自上海生命科学院、复旦大学、浙江大学等国内知名科研院所和高校的50余位同步辐射应用领域的专家学者以及上海应用物理所的相关科研人员参加了会议。

上海光源工程总经理、上海应用物理所所长徐洪杰报告了上海光源工程的建设进展。高能物理所冼鼎昌院士、国家纳米中心解思深院士、中国科技大学牛立文教授应邀分别以“同步辐射用于古生物学研究”、“同步辐射——纳米技术的发展与机遇”、“蛋白质机器及分子机制研究背景与展望简介”为题作了精彩报告。上海光源用户委员会筹备工作组负责人、上海分院副院长朱志远研究员介绍了用户委员会筹备工作安排及用户委员会章程起草原则。会议另有用户报告8个，涉及同步辐射在材料科学、高压科学、凝聚态物理、成像技术、医学应用等多学科领域的应用研究及前景。会议听取了上海光源首批建设的7个光束线站的专题介绍并进行了交流。与会人员还参观了上海光源工程建设工地。