1999年6月，中科院向国家科教领导小组第五次会议提交了“中国高能物理发展战略”，汇报了中国高能物理近期发展目标和中长期发展规划和BEPCII方案。国家科教领导小组决定增加BEPC年度运行经费，并安排设备改进和未来发展的R&D经费。