由中国科学院和云南省共同建设的中国西南野生生物种质资源库，2007年4月29日在昆明竣工。该种质资源库将成为国际上有重大影响、亚洲一流的野生生物种质保存设施和科学研究平台，为我国野生生物种质资源的保护、研究及合理利用提供技术支撑条件。

云南省有15000多种植物，约占全国的50%；脊椎动物有1704种，约占全国的55%；昆虫种类有100500种，约占全国的67%。1998年8月，吴征镒院士向朱镕基总理写信，提出“十分有必要尽快建设云南野生生物种质资源库”的建议得到国家的重视和支持。经国家发改委批准，按照中国科学院和云南省共建共管原则，昆明植物所作为工程建设法人单位，建设我国首座国家级野生生物种质资源库。2004年5月10日，作为温家宝总理访英议程的一部分，中英双方正式签署了《中国科学院与英国皇家丘植物园董事会关于野生植物种质资源保护和研究的合作协议》。

建设中国西南野生生物种质资源库是我国政府履行《生物多样性公约》、实施可持续发展战略的重要内容，将对中国参与全球生物技术产业竞争产生积极而深远的影响。该项国家重大科学工程将有力推动中科院知识创新工程西南基地的建设、进一步促进卓有成效的院省科技合作，对云南省乃至全国的生物多样性保护和生物资源的可持续利用、对云南的科学普及和教育等都有非常重要的意义。

资源库将收集保存云南省及周边地区和青藏高原的种质资源，以植物为主，兼顾动物和微生物。建成后的资源库包括种子库、植物离体种质库、DNA库、微生物种子库、动物种质库、信息中心和植物种质资源圃，将收集保存1.9万种19万份(株)种质资源。在第一个5年内达到6450种66500份(株/丛)，在10年至15年内建成国际上有重要影响、亚洲一流的野生生物种质资源设施和科学体系。截至2007年1月5日，共已入库3803份野生植物种子。