BEPCII中央控制室于2006年6月16日正式投入使用，标志着BEPCII储存环控制由系统调试转入与设备联调的实战阶段。 

新的中央控制台设计更加人性化，低噪声、低辐射,改善了操作员的工作环境。该系统采用当前国际加速器界普遍采用的EPICS组态软件包构造，控制技术先进，控制工具丰富，自动化程度高。新控制台的落成保证了控制各子系统按进度在中控台进行联调，控制组将根据工程进展计划完成与储存环各分系统的联调，并进一步完善调束软件。