2011年9月21日，蛋白质科学研究上海设施（以下简称“上海设施”）在北京中科院机关会议室召开第二次工程建设领导小组会议。会议由工程建设领导小组组长江绵恒主持，领导小组副组长李家洋和领导小组成员邓麦村、孔力、孔繁文、陈晓亚，工程建设科学技术委员会主任饶子和，有关部门负责人罗小安、王丽萍、邹凡，工程建设经理部张建新、吴家睿、李林、倪福弟、何建华、张荣光、雷鸣，江舸等参加了会议。

会议听取了上海设施工程建设经理部关于项目建设进展、工程设计及设计变更、蛋白质科学中心（上海）筹建工作的汇报。

会议对上海生命科学研究院及上海设施工程建设经理部有效推进上海设施建设和科学中心筹建工作表示充分肯定。

会议经过审议，原则同意上海设施工程建设经理部上报的《关于国家蛋白质科学研究（上海）设施工程建设设计变更的请示》，要求经理部抓紧组织落实上海设施有关设计变更调整及变更涉及的国家财政部进口仪器设备的批复调整等申报，院机关有关部门积极支持、推动项目的设计变更与概算调整等审批。

会议要求积极推动“国家蛋白质上海科学中心（筹）”的建设，充分利用此平台，发挥支撑设施建设、集聚培养人才、开展科学研究、提升综合能力的作用。院机关相关部门应积极支持，上海生命科学研究院应加大对高端人才引进的支持力度。

会议要求项目承建单位上海生命科学研究院及工程建设经理部进一步加强项目建设实施的组织与条件保障，光束线站建设加强协调、互相配合、相互融合，院各相关部门积极支持，推进上海设施建设，展示我院承担国家重大科技基础设施建设任务的优势和能力。