科研成果
    蛋白质设施用户揭示DDX21在抗病毒免疫应答中的结构基础

    2020-06-12

    季节性流感病毒在全球范围内每年会导致29-65万例死亡和300-500万例严重感染。而同属于单链RNA病毒的新型冠状病毒在2020年更是肆虐蔓延迅速发展成为了全球性的疫情,造成灾难性的损失。研究RNA类病毒的致病机理,对相关新药研发包括疫苗的研制都具有重要意义。 是一类重要的DEAD-box RNA解旋酶,兼具ATP依赖的RNA解旋酶活性和RNA折叠酶活性。

     季节性流感病毒在全球范围内每年会导致29-65万例死亡和300-500万例严重感染。而同属于单链RNA病毒的新型冠状病毒在2020年更是肆虐蔓延迅速发展成为了全球性的疫情,造成灾难性的损失。研究RNA类病毒的致病机理,对相关新药研发包括疫苗的研制都具有重要意义。 是一类重要的DEAD-box RNA解旋酶,兼具ATP依赖的RNA解旋酶活性和RNA折叠酶活性。DDX21在细胞生命周期中扮演多种重要角色,调控多种肿瘤组织的发生发展;还被报道与多...

    蛋白质设施用户完整揭示病毒RdRP核苷酸催化循环机制

    2020-06-12

    RNA病毒包括SARS、MERS、流感、埃博拉、寨卡和2019新冠等多种重要人类致病病原,其基因组复制过程完全不涉及DNA形式,因此需要自身编码的依赖RNA的RNA聚合酶(RNA-dependent RNA polymerase,简称RdRP)来主导完成。作为RNA病毒必须且最为保守的蛋白,RdRP催化RNA合成的分子机制是了解RNA病毒本质和研制抗RNA病毒的核苷类药物(如丙肝特效药索非布韦、抗新冠药物瑞德西韦、法匹拉韦等)的关键基础。国家蛋白质科学研究(上海)...

    蛋白质设施用户发现小G蛋白Rho亚家族不可逆变构抑制剂

    2020-05-25

    5月13日,国家蛋白质科学研究(上海)设施用户中国科学院上海药物研究所罗成课题组以及合作组,在Advanced Science上在线发表题为“Covalent inhibitors allosterically block the activation of Rho family proteins and suppress cancer cell invasion”的研究论文。该研究报道了小G蛋白Rho亚家族的共价抑制剂,发现其新型变构调控口袋,并阐明其变构调控分子机制。小G蛋白家族关键成员Rho亚家族是细胞内重要的调控因子,由于...

    蛋白质设施用户揭示植物蓝光受体CRY的光激活机制

    2020-05-20

    2020年5月11日,Nature Structural & Molecular Biology 在线发表了国家蛋白质科学研究(上海)设施用户中国科学院分子植物科学卓越创新中心张鹏研究组及其合作者的研究成果,题为“The oligomeric structures of plant cryptochromes”。研究工作报道了玉米和拟南芥蓝光受体CRY蛋白PHR结构域处于激活状态的寡聚体三维结构,揭示了植物蓝光受体CRY光激活的分子机制。CRY是一类进化上保守的黄素蛋白,具有多种生物学功能。在动物...

    蛋白质设施用户发现病原菌对宿主泛素分子进行苏氨酸ADP-核糖基化的新型翻译后修饰

    2020-05-07

    2020年4月23日,国家蛋白质科学研究(上海)设施用户浙江大学朱永群及其合作组在Molecular Cell杂志上发表题为“Threonine ADP-Ribosylation of Ubiquitin by a Bacterial Effector Family Blocks Host Ubiquitination”的研究论文,发现一类广泛存在于病原菌中的三型效应蛋白家族特异地对宿主泛素进行苏氨酸ADP-核糖基化修饰(threonine ADP-ribosylation)、并彻底阻断宿主泛素信号通路的全新机制。

    2020年4月23日,国家蛋白质科学研究(上海)设施用户浙江大学朱永群及其合作组在Molecular Cell杂志上发表题为“Threonine ADP-Ribosylation of Ubiquitin by a Bacterial Effector Family Blocks Host Ubiquitination”的研究论文,发现一类广泛存在于病原菌中的三型效应蛋白家族特异地对宿主泛素进行苏氨酸ADP-核糖基化修饰(threonine ADP-ribosylation)、并彻底阻断宿主泛素信号通路的全新机制。泛素是真核细胞特有的关键...

    蛋白质设施用户饶子和团队解析“药靶-药物”三维结构,揭示一线抗结核药物精确作用机制

    2020-04-26

    4月24日凌晨,国际顶尖学术期刊《Science》以研究长文(Research Article)形式,在线发表国家蛋白质科学研究(上海)设施用户上海科技大学免疫化学研究所饶子和院士研究团队与合作者的题为“Structures of cell wall arabinosyltransferases with the anti-tuberculosis drug ethambutol”的研究论文。该项工作在国际上首次成功解析了分枝杆菌关键的阿拉伯糖基转移酶复合体EmbA-EmbB和EmbC-EmbC的“药靶-药物”三维结构,首次揭示了一线抗结核药物乙胺丁醇作用于该靶点的精确分子机制,为解决结核病耐药问题,研发新型抗结核药物奠定了重要基础。

    4月24日凌晨,国际顶尖学术期刊《Science》以研究长文(Research Article)形式,在线发表国家蛋白质科学研究(上海)设施用户上海科技大学免疫化学研究所饶子和院士研究团队与合作者的题为“Structures of cell wall arabinosyltransferases with the anti-tuberculosis drug ethambutol”的研究论文。该项工作在国际上首次成功解析了分枝杆菌关键的阿拉伯糖基转移酶复合体EmbA-EmbB和EmbC-EmbC的“药靶-药物”三维结构,首次...

    蛋白质设施用户研究嗜肺军团菌一种谷氨酰胺转胺酶—MavC催化的泛素化反应及其抑制的分子机制

    2020-04-24

    2020年4月14日,国家蛋白质科学研究(上海)设施用户北京化工大学冯越研究组在《Nature Communications》发表了题为《Structural insights into the mechanism and inhibition of transglutaminase-induced ubiquitination by the Legionella effector MavC》的研究论文(Article),报道了嗜肺军团菌一种谷氨酰胺转胺酶—MavC催化的泛素化反应及其抑制的分子机制。蛋白质泛素化是最普遍的蛋白质翻译后修饰之一,是指泛素蛋白(...

    蛋白质设施质谱系统用户发文报道cGAMP跨细胞激活STING抗病毒感染新机制

    2020-04-20

    4月10日,国际学术期刊Immunity在线发表了国家蛋白质科学研究(上海)设施质谱系统合作用户中国科学院上海巴斯德研究所肖晖课题组的研究论文“Transfer of cGAMP into Bystander Cells via LRRC8 Volume-Regulated Anion Channels (VRACs) Augments STING-Mediated Interferon Responses and Anti-viral Immunity”。该研究发现阴离子通道LRRC8/VRAC是一个跨细胞膜转运cGAMP的转运蛋白,能将病毒感染细胞产生的cGAMP转运到非感...

    蛋白质设施质谱系统用户揭示MST4-YAP信号轴调控胃癌的功能机制

    2020-04-20

    Hippo信号通路在生物个体发育特别是组织器官大小和稳态调控过程中具有关键功能,同时在肿瘤发生及免疫应答过程中发挥十分重要的作用。在哺乳动物中,该通路主要是由MST1/2激酶(果蝇Hippo激酶的同源蛋白)和LATS1/2激酶在接头分子SAV1和MOB1的辅助下形成激酶级联反应,磷酸化该通路中发挥关键效应的转录激活子YAP或TAZ,使其滞留在细胞质中,进而发生降解。而Hippo信号一旦缺失,YAP/TAZ磷酸化水平下降并进入细胞核。虽然YAP/TA...

    国家蛋白质科学研究(上海)设施开通支持新冠肺炎病毒相关研究的快捷绿色通道

    2020-04-20

    作为国家生命科学领域的利器,在“新冠肺炎”疫情突袭,举国抗疫的关键时期,国家蛋白质科学研究(上海)设施,暨中国科学院上海高等研究院蛋白质科学中心,不忘初心,牢记使命,勇于践行身为重大科技基础设施的责任与义务,为广大科研工作者、医药研发、检测试剂开发企业提供坚实的后盾。为此,蛋白质设施专门制定了针对性的用户服务方案,全力支持与新冠肺炎病毒相关的蛋白质结构与致病机理研究、快速检测技术产品研发以及抗...

    国家蛋白质科学研究(上海)设施质谱系统利用整合型蛋白质小分子互作表征技术助力新冠病毒主蛋白酶药靶研究和候选药物发现

    2020-04-10

    (左)新冠病毒主蛋白酶-抑制剂N3的复合物结构;(右)冠状病毒主蛋白酶的底物结合口袋是一个保守药物设计靶点北京时间4月9日下午5点,经国际权威学术刊物《Nature》邀请投稿,上海科技大学饶子和/杨海涛团队与合作者组成的“抗新冠病毒攻关联盟”在该期刊上联合发表了新冠病毒的重要研究成果“Structure of Mpro from COVID-19 virus and discovery of its inhibitors”,率先在国际上成功解析新型冠状病毒关键药物靶点——主...

    国家蛋白质科学(研究)上海设施核磁分析系统用户揭示Hsp27在调控液液相分离和液固相转化中的作用

    2020-04-07

    北京时间2020年3月30日,国际著名学术期刊《Nature Structural & Molecular Biology》在线发表了上海有机化学研究所生物与化学交叉中心刘聪课题组与上海交通大学Bio-X研究院李丹课题组合作的最新研究成果“Hsp27 chaperones FUS phase separation under the modulation of stress-induced phosphorylation”。该研究发现分子伴侣-小热休克蛋白Hsp27在精密调控蛋白质的液-液相分离(LLPS),及液-固相转化(LSPT)中起到了至关重要的作用。

    北京时间2020年3月30日,国际著名学术期刊《Nature Structural & Molecular Biology》在线发表了上海有机化学研究所生物与化学交叉中心刘聪课题组与上海交通大学Bio-X研究院李丹课题组合作的最新研究成果“Hsp27 chaperones FUS phase separation under the modulation of stress-induced phosphorylation”。该研究发现分子伴侣-小热休克蛋白Hsp27在精密调控蛋白质的液-液相分离(LLPS),及液-固相转化(LSPT)中起到了至关重...

    国家蛋白质科学研究(上海)设施核磁分析系统用户通过运用In-Cell NMR等方法揭示脂质分子质膜相分离调控蛋白结构与功能的机理

    2020-04-07

    北京时间2020年3月30日凌晨,国际著名学术期刊《Nature Communications》在线发表了上海有机化学研究所生物与化学交叉中心刘聪课题组与上海交通大学Bio-X研究院李丹课题组合作的最新研究成果

    北京时间2020年3月30日凌晨,国际著名学术期刊《Nature Communications》在线发表了上海有机化学研究所生物与化学交叉中心刘聪课题组与上海交通大学Bio-X研究院李丹课题组合作的最新研究成果“Different regions of synaptic vesicle membrane regulate VAMP2 conformation for the SNARE assembly”。该研究通过联合运用细胞内核磁共振波谱(in-cell NMR)为主的多种方法方法,系统研究了突触小泡膜上的脂质分子局部相分离形成...

    国家蛋白质科学研究(上海)设施质谱系统用户解析新冠病毒重要药物靶点-RNA依赖的RNA聚合酶三维精细结构

    2020-03-20

    近日,“上海科技大学-清华大学抗新冠病毒联合攻关团队”率先在国际上成功解析新型冠状病毒“RdRp(RNA依赖的RNA聚合酶)-nsp7-nsp8复合物”近原子分辨率的三维空间结构,揭示了该病毒遗传物质转录复制机器核心“引擎”的结构特征,为开发针对新冠肺炎的药物奠定了重要基础。

    近日,“上海科技大学-清华大学抗新冠病毒联合攻关团队”率先在国际上成功解析新型冠状病毒“RdRp(RNA依赖的RNA聚合酶)-nsp7-nsp8复合物”近原子分辨率的三维空间结构,揭示了该病毒遗传物质转录复制机器核心“引擎”的结构特征,为开发针对新冠肺炎的药物奠定了重要基础。图注:新型冠状病毒RdRp-nsp7-nsp8聚合酶复合物2.9 埃分辨率电子显微结构(Coulomb potential map)。螺旋状分子为类比同类机制聚合酶判断的RNA模版链(...

    国家蛋白质科学研究(上海)设施五线六站用户揭示细胞焦亡中Caspase识别GSDMD的结构机理

    2020-03-02

    2020年2月27日,中科院生物物理所丁璟珒课题组和北京生命科学研究所邵峰课题组合作在《Cell》杂志上发表题为“Structural Mechanism for GSDMD Targeting by Autoprocessed Caspases in Pyroptosis ”的文章。该研究从结构学角度发现了caspase-1/4/11-GSDMD复合物形成中的关键特点。

    细胞焦亡(Pyroptosis)是病原体感染或者内源性刺激时细胞发生的程序性死亡,会释放大量炎性因子并引起更加强烈的炎症反应。炎症小体激活Caspase-1,LPS激活Caspase-4/5/11后形成二聚体,之后发生自切割产生p20和p10。GSDMD的272FLTD275(小鼠的为273LLSD276)位点会被激活的Caspase-1/4/5/11识别并切开,切割后的GSDMD会去除抑制性GSDMD-C结构域,释放出能够在细胞膜上成孔的GSDMD-N结构域,细胞膜上的孔释放出炎性物质,造成...